- Sau khi nhận lời mời của một huấn luyện viên bí ẩn, Ash, Misty và Brock gặp Mewtwo – một Pokémon nhân tạo muốn gây chiến.
- Câu chuyện bắt đầu với một tên được coi là mối đe dọa của chính phủ Nhật Bản, nhưng óc siêu phàm Conan sẽ ngăn chặn mọi tai họa có thể ập đến khi đườn